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Hallo, Ich bin Patrick

Patrick Meier

IT Berater / Software-Entwickler bei Consenso

Als IT-Berater und Data Engineer entwickle ich maßgeschneiderte Lösungen, die genau auf die individuellen Anforderungen unserer Kunden zugeschnitten sind. Mit einem breiten Fachwissen in den Bereichen Projektmanagement, Softwareentwicklung, Stammdatenmanagement sowie Business Intelligence und Data Analytics arbeite ich daran, innovative Lösungen zu entwickeln, die unseren Kunden helfen, ihre Ziele zu erreichen.

Team-fähig
Lösungs-orientiert
Anpassungs-fähig
Vielseitig
Lernfähig
Kommunikation

Fähigkeiten

Erfahrungen

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IT Berater / Dateningenieur
CONSENSO

Sep 2023 - heute, Liestal

IT & Digitale Unternehmensberatung

Verantwortlichkeiten:
  • Projektleitung
  • BI & Datenanalyse
  • Stammdatenmanagement-Lösungen
  • System-Integration

Health Informatics Specialist
Schweizerisches Tropen- und Public Health-Institut

Jan 2023 - Feb 2024, Allschwil

Swiss Centre for International Health (SCIH) | Digital Health Unit

Verantwortlichkeiten:
  • Entwicklung von internationalen eCDSS-Lösungen für das Krankheitsmanagement
  • Übersetzung von narrativen Versorgungsleitlinien in strukturierte Komponenten
  • Einbeziehung von Standards für medizinische Daten
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Wissenschaftlicher Assistent | Software Entwickler
FHNW

Aug 2020 - Dec 2022, Muttenz

Fachhochschule Nordwestschweiz FHNW

Verantwortlichkeiten:
  • Full-Stack Software Entwicklung
  • Leitung des Projekts zur personalisierten Gesundheit PERSONALIS
  • Anwendung von Data Science auf heterogene Daten

Multimedia Elektroniker
Kilchenmann AG

2016 - 2017, Arlesheim

Professionelle Telekommunikations- und Multimediasysteme

Verantwortlichkeiten:
  • Installation und Wartung von Videokonferenzsystemen
  • Rackbau und serverbasierte Systeme
  • Beschallungssysteme und Großbildprojektionen
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Multimedia Elektroniker
Edi Blatter AG

2012 - 2014, Basel

Hochwertige Bang & Olufsen Multimedia-Systeme

Verantwortlichkeiten:
  • Installation und Wartung von Bang & Olufsen Systemen
  • Projektierung von AV-Lösungen
  • Vertrieb und eigenständige Auftragsabwicklung

Multimedia Elektroniker
Glanzmann Multimedia AG

2011 - 2012, Allschwil

Multimedia Systeme

Verantwortlichkeiten:
  • Installation und Wartung von Audio-Video-Systemen
  • Projektierung von AV-Lösungen
  • Vertrieb und unabhängige Auftragsabwicklung
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Lehre als Multimedia Elektroniker EFZ
Glanzmann Multimedia AG

2007 - 2011, Allschwil

Multimedia Systeme

Verantwortlichkeiten:
  • Installation und Wartung von Audio-Video-Systemen
  • Projektierung von AV-Lösungen
  • Vertrieb und unabhängige Auftragsabwicklung

Ausbildung

MSc. in Medical Informatics
Note: 5.5 aus 6
Belegte Kurse
  • Digital Transformation in Healthcare
  • BioMedical Data Science
  • Medical Software Development
  • Digitalization of Business Processes
  • Artificial Intelligence in Drug Discovery
  • Applied Computational Intelligence
  • Innovation Trends in Medical Informatics
BSc. in Life Science Technologies | Medical IT
Note: 5.5 aus 6
Belegte Kurse
  • Data Science
  • Software Entwicklung
  • Visualisierung und Benutzerinteraktion
  • Bildgebende Verfahren
  • Medizinische Informationssysteme
  • Bioinformatik
  • Management

Projects

Machine learning for precision diagnostics of autoimmunity
Machine learning for precision diagnostics of autoimmunity
Nov 2024

Unser Artikel über eine neue Integrationspipeline, die Multi-omics-, klinische und Labordaten kombiniert, um eine Genauigkeit von bis zu 96 % bei der Diagnose von Autoimmunkrankheiten zu erreichen, bietet anpassbare Anwendungen für eine breitere Krankheitsdiagnostik.

Master Thesis
Master Thesis
Jan 2024

Automatisierte Übersetzung von narrativen Pflegeleitlinien in strukturierte Komponenten zur Integration in elektronische Systeme zur Unterstützung klinischer Entscheidungen - eine Machbarkeitsstudie

The dengue-specific immune response and antibody identification with machine learning
The dengue-specific immune response and antibody identification with machine learning
Jan 2024

Die Arbeit untersucht die Dengue-Antikörperreaktion mithilfe von fortschrittlicher Sequenzierung und maschinellem Lernen und gibt Einblicke in Veränderungen der Diversität, die Architektur des Repertoires und die Identifizierung seltener breit neutralisierender Antikörpersequenzen.

EmCare - digital solution to implement WHO SMART Guidelines for newborn and child health
EmCare - digital solution to implement WHO SMART Guidelines for newborn and child health
Jan 2023

Em Care is a fully open-source, FHIR-native solution that can be configured to meet country- or site-specific requirements and integrated to Member State’s existing digital solutions. It is available for Android devices and built using the Android FHIR SDK which supports HL7 FHIR®/CQL. It will be available from the Google Play store or as a direct download to an Android Package Kit (APK)

Using the Light Gradient Boosting Machine for Prediction in QSAR Models
Using the Light Gradient Boosting Machine for Prediction in QSAR Models
Jun 2022

Ein angewandtes Computational Intelligence-Projekt zur Bestimmung, ob LightGBM ein geeigneter Ersatz für den in QSAR-Modellen weitverbreiteten Random Forest Classifier darstellt. Veröffentlicht und präsentiert auf der Konferenz IJCACI 2022.

cDR3AM
cDR3AM
Lead in Project Jan 2022 - Present

Eine kuratierte Datenbank mit Immun-Repertoires und Metadaten im AIRR-Format, die mit IgBLAST annotiert wurden.

GeneX
GeneX
Oct 2021

Eine Full-Stack-Anwendung zum Suchen und Filtern nach gewünschten Genen, die vom NCBI-FTP-Server heruntergeladen wurden. Mit Java Spring Boot, Maven, Apache Tomcat, SQL, npm und React.

Bioaktivät Vorhersage Anwendung
Bioaktivät Vorhersage Anwendung
Oct 2021

Vorhersage der Bioaktivität von Small Molecules im SMILES-Format auf ein bekanntes Zielmolekül, Monoaminoxidase B (MAO-B), einem Enzym zur Hemmung von Dopamin und daher ein bekanntes Arzneimittelziel für die Parkinson-Krankheit.

Machine Learning Detects Anti-DENV Signatures in Antibody Repertoire Sequences
Machine Learning Detects Anti-DENV Signatures in Antibody Repertoire Sequences
Oct 2021

Die Arbeit untersucht den Einsatz von Hochdurchsatz-Sequenzierungs- und maschinellen Lerntechniken, einschließlich neuronaler Netze, Zufallswälder und Support-Vector-Maschinen, um die Immunantwort auf das Dengue-Virus sowohl auf der Ebene des Antikörper-Repertoires als auch auf der Ebene der Sequenz zu analysieren und erkennbare Signaturen zu identifizieren, die zur Entdeckung von Antikörpern und zur Entwicklung von Impfstoffen beitragen könnten.

PERSONALIS
PERSONALIS
Projektleitung Aug 2020 - Sep 2022

PERSONALIS, ein klinisches Entscheidungshilfesystem, das darauf abzielt, komplexe Autoimmunerkrankungen durch die Anwendung von Modellen des maschinellen Lernens auf verschiedene Arten von medizinischen und molekularen Datensätzen für die Diagnose und Behandlung zu entschlüsseln.

Augmented reality tracking application
Augmented reality tracking application
Projektleitung Dec 2019 - Jan 2020

In C# geschriebene Microsoft Hololens-Anwendung unter Verwendung von Unity und Vuforia zur Erkennung von Arzneimittelverpackungen, die die zugehörigen Inhaltsstoffe und die entsprechenden Moleküle in 3D darstellen kann.

Medical image application
Medical image application
Software Entwickler Jul 2019

Entwicklung einer Krankenhausarchitektur für die Analyse von Bilddaten aus medizinischen Diagnosebildern. Full-Stack-Lösung mit der Möglichkeit, Ergebnisse nach bestimmten Kriterien oder mit Hilfe von Tags zu filtern. Die App wurde mit TypeScript, Vue.js, Node, Docker & PACS Server entwickelt.

Errungenschaften

Dozent im Medical Informatics Vorkurs

Unterrichten von angehenden Masterstudenten im Studiengang Medizininformatik. Vermittlung von Grundlagen der Programmierung und Datenverarbeitung mit Python.

Best Paper Auszeichnung

Auszeichnung für das beste Paper in der Kategorie Intelligente Systeme für unser Paper Using the Light Gradient Boosting Machine for Prediction in QSAR Models präsentiert auf der 6th International Joint Conference on Advances in Computational Intelligence. Das Paper ist bei Springer erhältlich: https://doi.org/10.1007/978-981-99-1435-7_10

Assistenzdozent Immunoinformatics Kurs

Next-Generation Sequencing (NGS) von Antikörperrepertoires. Hintergrund, Generierung von Diversität, derzeit verwendete Sequenzierungstechnologien und praktische Übungen zu den für die NGS-Datenanalyse verfügbaren computergestützten Tools. Vorverarbeitung und Analyse von Daten unter Verwendung der Programmierplattformen R und Python zusammen mit bestehenden Bioinformatik-Pipelines. Repertoire-Analyse zur statistischen Quantifizierung und Visualisierung von hochdimensionalen Daten.

sciCORE linux and cluster introduction Kurs

Grundlegende Kenntnisse der Linux/UNIX-Umgebung und des High Throughput und High Performance Computing. Nutzung der sciCORE-Infrastruktur für wissenschaftliche Anwendungen (einschließlich praktischer Übungen). Effektive und effiziente Nutzung von Clustern.

Intermediate Python Kurs

Analysieren, Umwandeln und Erforschen von Daten mit Pandas. Durchführen von statistischen Simulationen und Tests mit Numpy/Scipy. Effiziente und aussagekräftige Darstellung von Daten mit seaborn. Beschleunigung Ihres Python-Codes mit numba und mehr.

Swiss Engineering Award

Auszeichnung für den Abschluss des BSc in Life Science Technologies als Jahrgangsbester in der Spezialisierung Medical Informatics

SQL Island Herausforderung

Abschlusszertifikat für die SQL Island Challenge, eine spielerische Lernerfahrung zur Beherrschung der SQL-Grundlagen.